Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2al1nQ497L1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms