Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms