Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6899Q3USS0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms