Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms