Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trappc10Q3TLI0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc10Q3TLI0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms