Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp39Q3TIX9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms