Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms