Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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