Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms