Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms