Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RykQ01887 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177 ms