Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VcpQ01853 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VcpQ01853 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms