Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms