Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms