Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pde1bQ01065 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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