Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mesp1P97309 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mesp1P97309 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms