Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfn1P62962 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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