Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms