Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rims4P60191 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms