Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P58686 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P58686 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P58686 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P58686 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P58686 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P58686 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P58686 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P58686 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P58686 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P58686 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P58686 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P58686 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P58686 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P58686 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P58686 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P58686 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P58686 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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