Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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