Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms