Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtgfrP43117 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms