Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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