Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a2P20490 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms