Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VimP20152 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VimP20152 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VimP20152 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VimP20152 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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