Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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