Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms