Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PolP10400 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PolP10400 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms