Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ndufb1P0DN34 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms