Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarce1O54941 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms