Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccl25O35903 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms