Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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