Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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E030018B13RikJ3QMS9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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E030018B13RikJ3QMS9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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