Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem200cJ3QK46 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms