Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21863J3KMP8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21863J3KMP8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21863J3KMP8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21863J3KMP8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21863J3KMP8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm21863J3KMP8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21863J3KMP8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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