Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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