Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Taf4E9QAP7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms