Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms