Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Ccdc71lE9Q4T4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc71lE9Q4T4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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