Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt78E9Q0F0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms