Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms