Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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