Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rfx8D3YU81 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rfx8D3YU81 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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