Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf11bB4XVQ1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms