Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usf3B2RUQ2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms