Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Trabd2bB1ATG9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trabd2bB1ATG9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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