Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms