Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms