Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms